A qualidade do DNA é de fundamental importância quando se objetiva avaliar a diversidade genética em espécies arbóreas por meio de reação em cadeia da polimerase (PCR). Impurezas presentes no DNA podem influenciar negativamente as sensíveis reações da PCR. O objetivo do presente estudo foi avaliar a qualidade do DNA extraído a partir de folha e caule de Hancornia speciosa. O DNA foi extraído do tecido caulinar e foliar de cinco indivíduos. A quantificação foi realizada por meio de espectrofotometria e eletroforese em gel de agarose. O material genético obtido a partir do caule apresentou pureza semelhante ao extraído da folha, obtendo valores para a razão entre as absorvâncias (A₂₆₀/A₂₈₀) de 1,46 para o caule e de 1,42 para a folha, ficando, ambos, um pouco abaixo do valor considerado ótimo que é entre 1,5 e 2,5. O tecido caulinar apresentou um DNA de qualidade semelhante ao da folha, sendo sua utilização viável para estudos moleculares em H. speciosa.