O El Niño e a La Niña podem ter impactos significativos nas condições de seca. Assim, objetivou-se caracterizar os padrões espaciais da mortalidade de fustes e árvores para ano de El Niño (2016) e La Niña (2020) em remanescente de caatinga no estado de Pernambuco, Brasil, via modelagem geoestatística. A mortalidade de fuste e árvores foram monitorados em 80 parcelas permanentes localizadas em um remanescente de floresta tropical sazonalmente seca. O modelo de semivariograma gaussiano melhor representou a variabilidade espacial da mortalidade de fustes e árvores. Foi verificado um efeito das secas no aumento das taxas de mortalidade em 2016, no entanto em 2020 houve estabilização desses valores. Conclui-se que o método de interpolação espacial da krigagem forneceu uma espacialização consistente das variáveis. Os resultados desta pesquisa contribuíram para orientar a tomada de decisões no manejo florestal sustentável de áreas secas, com o objetivo de reduzir os impactos ambientais decorrentes das atividades humanas e naturais.